Reagen Fosforilasi untuk Triposforilasi Gugus 5'-Hidroksil Oligonukleotida
5-Chlorosaligenyl-N,N-diisopropylphosphoramidite (C3326) merupakan reagen fosforilasi yang digunakan untuk memasukkan gugus trifosfat pada ujung 5' oligonukleotida. Reagen ini efektif dalam triposforilasi gugus 5'-hidroksil dan dapat digunakan untuk sintesis RNA maupun DNA, serta pada sintesiser oligonukleotida. Dalam urutan reaksi, gugus 5'-hidroksil difosfitilasi dengan C3326 bersama BTT dalam CH3CN, kemudian dioksidasi dengan iodin dalam piridin/H2O/THF menghasilkan ester 5'-siklofosfat sebagai intermediet. Intermediet ini selanjutnya bereaksi dengan Bis(tetrabutylammonium) Dihydrogen Pyrophosphate (B5440) dalam DMF sehingga gugus trifosfat terikat. Urutan ini dapat diterapkan pada sintesis fase padat maupun sintesiser oligonukleotida standar, dan deproteksi akhir menggunakan aq. NH3/aq. CH3NH2 (AMA), dengan TBAF (T1338) untuk RNA.¹)
Produk terkait
- TCI C3326 1620086-77-2 5-Chlorosaligenyl-N,N-diisopropylphosphoramidite
- TCI B5440 857447-79-1 Bis(tetrabutylammonium) Dihydrogen Pyrophosphate
- TCI B3020 21871-47-6 5-(Benzylthio)-1H-tetrazole
- TCI I0604 7553-56-2 Iodine
- TCI T1338 429-41-4 Tetrabutylammonium Fluoride (ca 1mol/L in Tetrahydrofuran)
Referensi
- Solid‐Phase Synthesis of DNA and RNA 5′‐O‐Triphosphates Using cycloSal Chemistry. I. Sarac, C. Meier, Curr. Protoc. Nucleic Acid Chem. 2016, 64:4.67.1-4.67.14. doi:10.1002/0471142700.nc0467s64
Unduh brosur TCI Phosphorylating Reagents for the Synthesis of Nucleotide 5'-O-Triphosphates (PDF)
Sumber
- TCI Product Highlights: www.tcichemicals.com/ID/en/product/tci-topics/ProductHighlights_20191125
- Halaman produk TCI C3326: tcichemicals.com/ID/en/p/C3326
- Halaman produk TCI B5440: tcichemicals.com/ID/en/p/B5440
- Brosur TCI PP009: Phosphorylating Reagents for the Synthesis of Nucleotide 5'-O-Triphosphates
Untuk penggunaan riset dan laboratorium, bukan untuk konsumsi.
