5-Ethynyluridine TCI E1560

Identitas Kimia

Nama lain: 5-EU · 1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl]-5-ethynylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
No. CAS: 69075-42-9
Rumus molekul: C11H12N2O6
Berat molekul: 268.23 g/mol
Kemurnian: >95.0%(T)(qNMR)
Suhu simpan: 0-10°C

Identifier lengkap (IUPAC, SMILES, InChIKey)

IUPAC: 1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-ethynylpyrimidine-2,4-dione
SMILES: C#CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2C(C(C(O2)CO)O)O
InChIKey: QCWBIPKYTBFWHH-FDDDBJFASA-N
MDL: MDL00876719
PubChem: CID 14885960

Rp 1.936.200,00

Obral Habis

Biaya pengiriman dihitung saat checkout.

Berat 50mg 250mg

Pembayaran hanya melalui request quotation dan dilakukan setelah tim kami menghubungi Anda. Mohon cantumkan nomor WhatsApp aktif untuk konfirmasi pesanan & pembuatan invoice. Estimasi pengiriman 4-5 minggu setelah pembayaran.

Dokumen Keamanan & Mutu

↓ Unduh SDS / MSDS (PDF resmi TCI)

CoA (Certificate of Analysis)

Spesifik per batch produksi — diterbitkan dan dikirim bersama barang sesuai nomor lot yang Anda terima.

Contoh CoA segera tersedia.

💬 Minta CoA via WhatsApp

Lihat detail lengkap

5-Ethynyluridine, yang umum disingkat EU, adalah analog nukleosida uridin yang membawa gugus etinil pada posisi 5 cincin urasil. Senyawa ini merupakan reagen kunci pada penelitian biologi molekuler untuk melabeli RNA yang baru disintesis di dalam sel. Prinsip kerjanya sederhana namun elegan: sel yang diberi EU akan memasukkan analog ini ke dalam RNA yang sedang ditranskripsi, lalu gugus etinil yang tertanam di dalam RNA dideteksi melalui reaksi click dengan pewarna berlabel azida. Hasilnya adalah gambaran aktivitas transkripsi yang dapat divisualisasikan langsung.

Keunggulan yang membuat EU dipilih terletak pada ukuran gugus etinil yang sangat kecil sehingga gangguannya terhadap proses biologis minimal, serta pada selektivitas reaksi click yang nyaris tidak menyentuh gugus fungsi lain dalam sel. Pendekatan ini menggantikan metode lama berbasis nukleosida bertanda radioaktif atau antibodi, karena tidak memerlukan penanganan bahan radioaktif dan tidak menuntut denaturasi keras untuk membuka akses probe. Deteksi berbasis click juga menghasilkan sinyal yang tajam dengan latar belakang rendah, sehingga cocok untuk mikroskopi fluoresensi maupun analisis aliran sitometri. Sebagai analog uridin, EU spesifik untuk RNA, berbeda dari analog timidin yang menyasar DNA.

Di laboratorium Indonesia, reagen ini relevan bagi kelompok riset biologi molekuler, bioteknologi, virologi, onkologi, dan ilmu hayati di universitas maupun lembaga penelitian yang mengkaji regulasi ekspresi gen. Kemasan 50 miligram dan 250 miligram menyesuaikan kebutuhan kerja berbasis kultur sel, di mana reagen dipakai dalam konsentrasi mikromolar pada volume medium yang terbatas, sehingga satu kemasan kecil dapat menopang banyak percobaan.

Pelabelan RNA baru: EU diinkorporasi ke dalam transkrip yang sedang disintesis sehingga peneliti dapat membedakan RNA baru dari RNA yang sudah ada sebelumnya.
Deteksi berbasis click chemistry: gugus etinilnya bereaksi dengan pewarna azida melalui CuAAC sehingga RNA bertanda dapat divisualisasikan dengan mikroskop fluoresensi.
Pengukuran laju transkripsi global: intensitas sinyal hasil pelabelan dapat dipakai menilai perubahan aktivitas transkripsi akibat perlakuan obat, stres, atau kondisi kultur tertentu.
Analisis aliran sitometri: sel bertanda EU dapat dikuantifikasi secara populasi untuk melihat proporsi sel dengan aktivitas transkripsi tinggi maupun rendah.
Studi nukleosida termodifikasi: sebagai analog uridin bergugus alkuna, senyawa ini juga bermanfaat pada sintesis oligonukleotida termodifikasi dan pengembangan probe asam nukleat.

Merek	TCI (Tokyo Chemical Industry)
Nomor CAS	69075-42-9
Rumus molekul	—
Kemurnian	—
Kategori	Chemistry > Chemical Biology > Conjugation Chemistry/Click Chemistry
Ukuran kemasan	50 mg dan 250 mg
Bentuk fisik	padatan/serbuk analog nukleosida
Penyimpanan	simpan dalam keadaan dingin, kering, dan terlindung cahaya; tutup rapat untuk mencegah penyerapan uap air

Simpan reagen dalam wadah tertutup rapat di tempat dingin, kering, dan gelap sesuai anjuran pada label kemasan, karena analog nukleosida umumnya lebih awet pada suhu rendah. Biarkan botol mencapai suhu ruang sebelum dibuka agar uap air tidak mengembun di dalam wadah dan merusak serbuk. Gunakan spatula kering serta timbang di ruang berventilasi baik dengan sarung tangan nitril, kacamata pelindung, dan jas laboratorium. Larutan stok sebaiknya dibuat dalam pelarut yang sesuai, dibagi menjadi alikuot kecil, dan disimpan beku agar tidak mengalami siklus beku-cair berulang.

Tabata dkk. (1997). Antitumor mechanisms of 3′-ethynyluridine and 3′-ethynylcytidine as RNA synthesis inhibitors: development and characterization of 3′-ethynyluridine- resistant cells. Cancer Letters doi:10.1016/s0304-3835(97)00188-2
Neitz dkk. (2023). A tolane-modified 5-ethynyluridine as a universal and fluorogenic photochemical DNA crosslinker. Chemical Communications doi:10.1039/d3cc03796g
Liboska dkk. (2012). Most Anti-BrdU Antibodies React with 2′-Deoxy-5-Ethynyluridine — The Method for the Effective Suppression of This Cross-Reactivity. PLoS ONE doi:10.1371/journal.pone.0051679

Referensi dihimpun otomatis dari Crossref dan setiap DOI diverifikasi keberadaannya. AMI Scientific tidak berafiliasi dengan penulis maupun penerbit.