Pseudouridine TCI P2396

TCI P2396 Pseudouridine adalah nukleosida termodifikasi yang merupakan isomer dari uridin. Berbeda dengan uridin yang basa urasilnya terikat ke gula ribosa melalui atom nitrogen, pada pseudouridin basa tersebut terikat melalui atom karbon, sehingga membentuk ikatan C-glikosida. Pseudouridin dikenal sebagai salah satu modifikasi RNA yang paling melimpah di alam, ditemukan pada tRNA, rRNA, dan berbagai RNA lainnya. Di laboratorium, senyawa ini berperan sebagai standar analitik, bahan kajian biokimia RNA, dan materi riset dalam kimia asam nukleat.

Ikatan C-glikosida memberikan sifat unik pada pseudouridin. Selain lebih tahan terhadap pemutusan ikatan glikosidik, cincin urasilnya memiliki gugus NH tambahan yang dapat menjadi donor ikatan hidrogen. Hal ini memengaruhi kestabilan struktur RNA dan interaksinya dengan molekul lain. Pseudouridin dan turunannya juga terkenal dalam riset mRNA terapeutik karena penggantian uridin dengan nukleosida termodifikasi terbukti mengurangi respons imun bawaan terhadap mRNA sintetis. Karena itu, senyawa ini penting sebagai pembanding dalam studi modifikasi RNA.

Di Indonesia, riset biologi molekuler, bioteknologi, dan pengembangan vaksin terus bertumbuh, baik di universitas, lembaga riset nasional, maupun industri farmasi. Pseudouridin relevan sebagai standar untuk analisis nukleosida termodifikasi dengan LC-MS atau HPLC, dan sebagai bahan studi fundamental tentang epitranskriptomik. Kemasan 50mg sesuai dengan kebutuhan analitik yang biasanya hanya memerlukan jumlah kecil untuk pembuatan larutan stok dan kurva kalibrasi.

• Standar analitik untuk analisis nukleosida termodifikasi: pseudouridin murni diperlukan sebagai pembanding waktu retensi dan spektrum massa saat mengkuantifikasi modifikasi RNA dengan HPLC atau LC-MS.
• Riset epitranskriptomik dan modifikasi RNA: senyawa ini menjadi acuan penting untuk mempelajari peran pseudouridilasi dalam struktur, stabilitas, dan fungsi berbagai jenis RNA di dalam sel.
• Studi pembanding dalam riset mRNA sintetis: pseudouridin dapat dipakai sebagai referensi saat mengevaluasi komposisi nukleosida termodifikasi pada mRNA hasil transkripsi in vitro.
• Kajian enzim pseudouridin sintase: sebagai produk reaksi enzimatik, pseudouridin murni berguna untuk validasi metode deteksi serta penentuan aktivitas enzim yang mengisomerisasi uridin dalam RNA.
• Riset biomarker klinis: pseudouridin dalam cairan biologis seperti urin telah dikaji sebagai penanda potensial, sehingga standar murni diperlukan untuk pengembangan dan validasi metode kuantifikasi.

Nukleosida sebaiknya disimpan dalam wadah asli yang tertutup rapat, terlindung dari kelembapan, dan pada suhu sesuai petunjuk label, biasanya di lemari pendingin. Biarkan wadah mencapai suhu ruang sebelum dibuka agar tidak terjadi kondensasi uap air. Untuk aplikasi biologi molekuler, gunakan peralatan dan pelarut bebas RNase serta sarung tangan bersih untuk mencegah kontaminasi. Larutan stok sebaiknya dibagi ke dalam beberapa alikuot agar tidak berulang kali dibekukan dan dicairkan. Baca SDS TCI sebelum digunakan.

• Tomikawa (2025). Pseudouridine Modifications in Transfer RNA and tRNA Pseudouridine Synthases. Journal of Molecular Biology doi:10.1016/j.jmb.2025.169183
• Chen dkk. (2022). N1-methyl-pseudouridine is incorporated with higher fidelity than pseudouridine in synthetic RNAs. Scientific Reports doi:10.1038/s41598-022-17249-1
• Shanmugasundaram dkk. (2019). Highly regio- and stereoselective Michael addition of pseudouridine with propiolates: An efficient method for the synthesis of (E)-pseudouridine-N1-acrylate. Tetrahedron Letters doi:10.1016/j.tetlet.2018.12.001

Referensi dihimpun otomatis dari Crossref dan setiap DOI diverifikasi keberadaannya. AMI Scientific tidak berafiliasi dengan penulis maupun penerbit.