2'-Deoxycytidine 5'-Monophosphate Hydrate TCI D3673

Deskripsi

TCI D3673 2'-Deoxycytidine 5'-Monophosphate Hydrate, yang lazim disingkat dCMP, adalah nukleotida deoksiribosa yang terdiri atas basa sitosin, gula 2'-deoksiribosa, dan satu gugus fosfat pada posisi 5'. Senyawa ini merupakan salah satu unit penyusun dasar DNA sehingga menempati posisi penting sebagai reagen biokimia. Di laboratorium, dCMP dipakai sebagai substrat maupun produk acuan dalam kajian metabolisme nukleotida, sebagai bahan pembanding pada analisis komposisi asam nukleat, serta sebagai titik awal sintesis turunan nukleotida. Bentuk hidrat menunjukkan adanya molekul air terikat dalam kristal, hal yang perlu diperhatikan saat perhitungan massa molar untuk pembuatan larutan berkonsentrasi tepat.

Sifat yang membuat reagen ini banyak dipilih adalah kelarutannya yang baik dalam media berair, kestabilan yang memadai sebagai padatan bila disimpan dingin dan kering, serta identitas kimia yang terdefinisi jelas sehingga cocok menjadi baku kerja analisis. Gugus fosfat memberi sifat asam dan muatan negatif yang dimanfaatkan pada pemisahan dengan kromatografi pertukaran ion maupun kromatografi cair fase balik berpasangan ion. Basa sitosin memiliki serapan ultraviolet khas yang memudahkan deteksi dan penetapan kadar secara spektrofotometri. Dua ukuran kemasan yang tersedia memungkinkan pemakaian hemat untuk validasi metode maupun penyediaan bahan yang cukup untuk reaksi enzimatik berulang dan sintesis lanjutan.

Laboratorium biologi molekuler, biokimia, dan farmasi di Indonesia umumnya memakai nukleotida seperti ini untuk penelitian enzimologi, praktikum lanjut biokimia asam nukleat, serta pengembangan metode analisis berbasis kromatografi cair kinerja tinggi. Karena reagen bersifat biologis dan sebaiknya disimpan dingin, laboratorium perlu memastikan rantai penyimpanan yang tertib sejak penerimaan barang. Praktik yang lazim adalah menyiapkan larutan stok, membaginya menjadi aliquot beku, serta mencatat lot dan tanggal pembukaan agar hasil antar-percobaan tetap dapat dibandingkan.

Aplikasi Laboratorium

• Kajian enzimologi nukleotida seperti kinase, nukleotidase, dan deaminase, karena dCMP dapat berperan sebagai substrat atau produk yang kadarnya diukur untuk menilai aktivitas enzim.
• Baku pembanding pada analisis kromatografi cair kinerja tinggi, sebab identitas kimianya jelas dan basa sitosin memberi serapan ultraviolet khas yang memudahkan deteksi kuantitatif.
• Penelitian metabolisme dan jalur penyelamatan nukleotida, karena senyawa ini merupakan simpul penting dalam pembentukan prekursor DNA di dalam sel hidup.
• Sintesis turunan nukleotida dan analog termodifikasi, sebab gugus fosfat serta gugus hidroksil gula menyediakan titik reaksi yang dapat difungsionalisasi secara terarah.
• Praktikum lanjut biokimia asam nukleat, karena bahan ini memberi contoh nyata unit penyusun DNA yang dapat dianalisis dengan spektrofotometri maupun elektroforesis sederhana.

Spesifikasi

• Merek: TCI
• Nomor CAS: 1032-65-1
• Kategori: Life Science > Biochemicals and Reagents > Nucleosides, Nucleotides, Oligonucleotides
• Varian/kemasan: 100 mg dan 1 g
• Bentuk fisik: padatan atau serbuk dalam bentuk hidrat (rujuk sertifikat analisis lot)
• Catatan penyimpanan: simpan dingin dan kering, tertutup rapat, sesuai suhu yang dianjurkan pada label produsen

Penanganan dan Penyimpanan

Simpan dCMP dalam wadah aslinya yang tertutup rapat, di tempat kering dan pada suhu dingin sesuai anjuran produsen, karena nukleotida lebih tahan lama bila terhindar dari panas dan kelembapan. Biarkan wadah mencapai suhu ruang sebelum dibuka agar tidak terjadi pengembunan yang dapat memengaruhi bobot bahan hidrat. Untuk pemakaian berulang, siapkan larutan stok dalam air bebas ion bermutu analisis atau bufer yang sesuai, bagi menjadi aliquot kecil, lalu simpan beku guna menghindari siklus beku-lebur berulang dan cemaran mikroba. Gunakan sarung tangan, kacamata pelindung, dan jas laboratorium, serta gunakan alat bersih dan bebas nuklease bila bahan dipakai pada percobaan asam nukleat.

English

TCI D3673 2'-Deoxycytidine 5'-Monophosphate Hydrate (dCMP, CAS 1032-65-1) is a deoxyribonucleotide composed of cytosine, 2'-deoxyribose and a 5'-phosphate group, one of the fundamental building units of DNA. It dissolves readily in aqueous media, carries a negatively charged phosphate useful for ion-exchange or ion-pair chromatographic separation, and shows the characteristic ultraviolet absorbance of the cytosine base for convenient quantification. Common applications include nucleotide enzymology with kinases and nucleotidases, nucleotide metabolism and salvage-pathway studies, HPLC reference standards, synthesis of modified nucleotide analogues, and advanced biochemistry teaching laboratories. Supplied in 100 mg and 1 g packs; the hydrate form should be considered when calculating molar concentrations. Store cold and dry.

Referensi Ilmiah

• Kočišek dkk. (2018). Electron Attachment to Microhydrated Deoxycytidine Monophosphate. The Journal of Physical Chemistry B doi:10.1021/acs.jpcb.8b03033
• Havliš dkk. (2001). High-performance liquid chromatographic determination of deoxycytidine monophosphate and methyldeoxycytidine monophosphate for DNA demethylation monitoring: experimental design and artificial neural networks optimisation. Journal of Chromatography B: Biomedical Sciences and Applications doi:10.1016/s0378-4347(01)00075-5

Referensi dihimpun otomatis dari Crossref dan setiap DOI diverifikasi keberadaannya. AMI Scientific tidak berafiliasi dengan penulis maupun penerbit.