Pembayaran hanya melalui request quotation dan dilakukan setelah tim kami menghubungi Anda. Mohon cantumkan nomor WhatsApp aktif untuk konfirmasi pesanan & pembuatan invoice. Estimasi pengiriman 4-5 minggu setelah pembayaran.
Deskripsi
TCI D4220 2'-Deoxy-5-(hydroxymethyl)cytidine adalah nukleosida termodifikasi berupa deoksisitidin yang membawa gugus hidroksimetil pada posisi 5 cincin pirimidin. Senyawa ini merupakan bentuk nukleosida dari basa 5-hidroksimetilsitosin, salah satu penanda epigenetik yang muncul ketika enzim keluarga TET mengoksidasi 5-metilsitosin pada DNA. Di laboratorium, perannya adalah sebagai standar analitik dan bahan rujukan bagi peneliti yang mengukur, memvalidasi, atau menelusuri modifikasi basa DNA, sekaligus sebagai bahan awal untuk menyiapkan turunan fosforamidit maupun probe penelitian.
Sifat yang membuatnya penting adalah relevansi biologisnya yang tinggi dipadukan dengan struktur kimia yang terdefinisi jelas. Karena 5-hidroksimetilsitosin hadir dalam jumlah sangat kecil di dalam genom, kuantifikasinya sangat bergantung pada ketersediaan standar murni untuk membuat kurva kalibrasi pada analisis LC-MS/MS. Gugus hidroksimetil juga menyediakan titik reaktif yang dapat diderivatisasi lebih lanjut, misalnya untuk pelabelan selektif atau pemasangan penanda afinitas. Sebagai nukleosida, senyawa ini larut baik dalam media berair dan campuran pelarut yang lazim digunakan pada analisis kromatografi, sehingga siap dipakai tanpa persiapan rumit.
Di Indonesia, laboratorium biologi molekuler, genetika, riset kanker, dan fasilitas layanan analisis di universitas maupun lembaga penelitian nasional semakin banyak menggarap topik epigenetika. Pilihan kemasan 50 mg dan 200 mg memberi keleluasaan: ukuran kecil untuk penyiapan larutan standar analitik, dan ukuran lebih besar bila senyawa dipakai sebagai bahan awal sintesis atau untuk keperluan rutin dalam jangka panjang.
Aplikasi Laboratorium
- Standar kalibrasi analisis LC-MS/MS modifikasi DNA, karena kuantifikasi 5-hidroksimetilsitosin dalam genom menuntut kurva standar dari senyawa rujukan bermutu tinggi.
- Riset epigenetika dan aktivitas enzim TET, sebab senyawa ini merupakan produk langsung jalur oksidasi 5-metilsitosin yang ingin dipantau peneliti.
- Bahan awal sintesis fosforamidit termodifikasi, karena gugus hidroksil pada nukleosida dapat dilindungi dan diaktifkan untuk sintesis oligonukleotida.
- Pembuatan oligonukleotida bertanda untuk uji fungsional, mengingat penyisipan basa termodifikasi diperlukan guna menguji pengenalan protein terhadap DNA teroksidasi.
- Studi metabolisme dan perbaikan DNA, karena senyawa ini menjadi pembanding penting saat menelusuri nasib basa termodifikasi di dalam sel maupun jaringan.
Spesifikasi
- Merek: TCI
- Nomor CAS: 7226-77-9
- Kategori: Chemistry > Chemical Biology > Nucleic Acid Chemistry
- Varian/kemasan: 50 mg dan 200 mg
- Bentuk fisik: padatan/serbuk pada suhu ruang; rujuk label dan Certificate of Analysis tiap lot
- Catatan penyimpanan: disarankan disimpan dingin, kering, tertutup rapat, terlindung cahaya
Penanganan dan Penyimpanan
Simpan senyawa dalam wadah aslinya yang tertutup rapat di lemari pendingin atau pembeku sesuai anjuran label, dengan perlindungan terhadap kelembapan dan cahaya. Biarkan wadah menyesuaikan diri dengan suhu ruang sebelum dibuka agar tidak terjadi kondensasi yang membuat serbuk menggumpal dan mengganggu ketelitian penimbangan. Gunakan spatula bersih dan kering serta timbangan analitik yang terkalibrasi, terutama bila senyawa dipakai sebagai standar kuantitatif. Larutan induk sebaiknya dibagi dalam alikuot kecil sekali pakai dan disimpan beku, lalu diberi label tanggal pembuatan. Kenakan sarung tangan, kacamata pengaman, dan jas laboratorium selama penanganan.
English
TCI D4220 2'-Deoxy-5-(hydroxymethyl)cytidine (CAS 7226-77-9) is the nucleoside form of 5-hydroxymethylcytosine, an epigenetic DNA mark generated when TET-family enzymes oxidise 5-methylcytosine. Its well-defined structure and good solubility in aqueous and common chromatographic solvents make it an essential calibration standard for LC-MS/MS quantification of modified bases, which occur at very low genomic abundance. The 5-hydroxymethyl group additionally offers a reactive handle for selective derivatisation, affinity tagging, or conversion into protected phosphoramidite intermediates for modified oligonucleotide synthesis. Researchers use it in epigenetics studies, TET enzyme assays, DNA repair and metabolism investigations, and functional experiments on protein recognition of oxidised DNA. Available in 50 mg and 200 mg packs.
![6-Bromobenzo[b]thiophene (CAS 17347-32-9) - TCI B5523 - AMI Scientific](http://amiscientific.com/cdn/shop/files/TCI2510B5523.jpg?v=1767092466&width=533)
![Benzo[b]benzo[4,5]thieno[2,3-d]thiophene (CAS 248-70-4) - TCI B5551 - AMI Scientific](http://amiscientific.com/cdn/shop/files/TCI2510B5551.jpg?v=1768815817&width=533)
